176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4133 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  59.15 
 
 
204 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  47.47 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  47.47 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  46.7 
 
 
221 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 
218 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  37.09 
 
 
208 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  37.91 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
228 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  33 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.34 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  35.44 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  29.72 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
234 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  32.17 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28.57 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28.57 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.41 
 
 
349 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  29.57 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
173 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
348 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  30.12 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 
267 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
349 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  30.35 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
339 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.95 
 
 
671 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 
409 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 
288 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
876 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 
354 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  30.95 
 
 
311 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
671 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.5 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.92 
 
 
652 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.5 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
671 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  30.29 
 
 
630 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  28.67 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  26.76 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  26.76 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  28.67 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  28.67 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.52 
 
 
629 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  30.26 
 
 
227 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 
248 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  29.94 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.02 
 
 
553 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  30.82 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 
336 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.32 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  30.07 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.79 
 
 
652 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.73 
 
 
233 aa  52  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  25.85 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
269 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
247 aa  51.6  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 
281 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 
243 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 
664 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
259 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
296 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>