222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3177 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  96.31 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  76.04 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  75.12 
 
 		 214 aa  330  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  76.04 
 
 		 214 aa  314  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  61.24 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  58.15 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  54.79 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  53.6 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  53.26 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  51.67 
 
 		 269 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  51.63 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  48.9 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  50.22 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  51.1 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  49.74 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  47.35 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  48.65 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  51.1 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  44.21 
 
 		 256 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  43.68 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  49.33 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  47.56 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  44.26 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  44.59 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  40.69 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  43.02 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  39.6 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  41.57 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  41.57 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  40.11 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  40.4 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.08 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  34.58 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  43.04 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  31.16 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  34.3 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  29.9 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  34.55 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  33.72 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 		 253 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 263 aa  91.7  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  32.4 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  27.51 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  26.98 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  28.51 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.73 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  27.78 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.25 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  25.25 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  29.59 
 
 		 629 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.85 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>