251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1170 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  57.84 
 
 
229 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  55.03 
 
 
225 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  53.55 
 
 
220 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  54.24 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  55.74 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  47.93 
 
 
210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  57.5 
 
 
217 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  58.13 
 
 
244 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  44.59 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  48.47 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  48.64 
 
 
217 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  48.64 
 
 
217 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  50.26 
 
 
256 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  47.27 
 
 
217 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  48.42 
 
 
243 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  47.09 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  46.19 
 
 
218 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  42.72 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  42.53 
 
 
220 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  42.73 
 
 
224 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  42.79 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  42.99 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  43.56 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  44.24 
 
 
214 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  46.28 
 
 
214 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  44.2 
 
 
222 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  45.2 
 
 
217 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  43.48 
 
 
223 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
211 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  38.73 
 
 
239 aa  132  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  41.67 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  41.76 
 
 
223 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  36.49 
 
 
209 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  36.99 
 
 
240 aa  127  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 
211 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  38.41 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  39.87 
 
 
205 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  40.13 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  40.13 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 
223 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  37.42 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.73 
 
 
227 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  29.7 
 
 
230 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  32.76 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
262 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
265 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  30.17 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 
227 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 
241 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
173 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
247 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.05 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
246 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  28.09 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  30.11 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  31.02 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  25.55 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  24.56 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.87 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.41 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  28.76 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  28.76 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.76 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  28.76 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  28.76 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  23.71 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  28.57 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>