77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4692 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  36.49 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  34.12 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  30.77 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  34.51 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  29.38 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.34 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  29.19 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  29.19 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  29.1 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  26.98 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  26.98 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  26.98 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  37.4 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.81 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  27.62 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.34 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  25.81 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  27.68 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.6 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.16 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  26.02 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  24.47 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  26.79 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  26.63 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  24.86 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  23.04 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  24.71 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  25 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  23.83 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  22.6 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  30.53 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  30.53 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  22.6 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  24.08 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24.28 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  24.6 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.7 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.7 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>