121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0065 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  40.89 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  39.87 
 
 		 270 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  34.73 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  37.19 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  37.19 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  36.68 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  34.73 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  36.18 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  37.21 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  35.76 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.15 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  35.19 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.76 
 
 		 244 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 220 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  32.93 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 256 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  31.28 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  33.11 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  30.88 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.34 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  31.44 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  29.82 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  28.65 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  25.82 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.67 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  28.64 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.33 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.33 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  28.48 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  31.51 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  35.65 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  31.51 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  27.22 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.92 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.12 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.8 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  22.29 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  38.82 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 268 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  24.28 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  30.82 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  42.31 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  25.4 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  25.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  26.19 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  26.19 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>