111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2269 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  34.15 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  35.02 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  31.4 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  29.38 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  31.22 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  27.17 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  26.59 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  27.05 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  26.59 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.41 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.22 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.22 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  26.97 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  25.29 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  26.26 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.19 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  25.43 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  26.16 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  23.2 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  22.34 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  21.13 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  22.46 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.75 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.32 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.88 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  22.07 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  22.6 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  21.58 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  23.62 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  22.03 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  23.49 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.36 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  24.62 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  21.95 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.16 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  23.6 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  22.82 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_002620  TC0449  hypothetical protein  27.72 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.308397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  32.79 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  21.3 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 876 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  22.41 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  21.81 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  21.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1777  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  22.4 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  21.79 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  31.75 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  27.16 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.16 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  26.74 
 
 		 652 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>