277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1371 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  74.53 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  41.85 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 		 349 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 354 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 		 232 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 348 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 349 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 217 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 214 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 335 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  30.07 
 
 		 234 aa  85.9  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  28.18 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.11 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.68 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.24 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  28.02 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  30.46 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.06 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  24.56 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.67 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.48 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 664 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  28.78 
 
 		 553 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  26.78 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  29.73 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.84 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  29.22 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  25.98 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  28.42 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  34.23 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  34.48 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.82 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>