More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0655 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  41.28 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  43.53 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.56 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  34.32 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.16 
 
 		 349 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 		 349 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.74 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 281 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.93 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  29.08 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  28.93 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  28.06 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  28.06 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 335 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 354 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  28.06 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  27.04 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  27.04 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.43 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 339 aa  85.5  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  27.54 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.59 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  27.59 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.42 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  25.51 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.62 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  28.72 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.41 
 
 		 652 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.3 
 
 		 652 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  32.52 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.25 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 876 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  25.68 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.19 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.63 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.19 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  25.45 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  29.03 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  24 
 
 		 624 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 664 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.74 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  26.38 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>