287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1352 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  44.29 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  41.34 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  46.29 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  41.29 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  41.9 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  37.93 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 348 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 		 232 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 		 354 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.77 
 
 		 217 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  26.13 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  26.13 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.13 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.13 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.13 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 293 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 335 aa  89  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  26.63 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.65 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  32.63 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.26 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  25.25 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.83 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 664 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.4 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32 
 
 		 671 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  36.67 
 
 		 876 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 671 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  28.14 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.17 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  28.89 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.14 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  27.68 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  25.17 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  29.05 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  29.05 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  27.23 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.9 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>