More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1181 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  49.03 
 
 
263 aa  286  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  48.81 
 
 
265 aa  258  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  48.18 
 
 
247 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  46.77 
 
 
240 aa  235  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
268 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
214 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 
236 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  41.85 
 
 
220 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  37.7 
 
 
241 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 
348 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  39.55 
 
 
349 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 
349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 
262 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  43.01 
 
 
671 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  43.01 
 
 
671 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 
242 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  35.42 
 
 
263 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  36.36 
 
 
275 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  39.38 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  41.97 
 
 
671 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 
255 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  37.13 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.59 
 
 
217 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.59 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  36.21 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  36.02 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 
339 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
254 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 
230 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
229 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
246 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
231 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.1 
 
 
216 aa  105  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 
228 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
243 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 
269 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
229 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 
251 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.73 
 
 
233 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  43.33 
 
 
664 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
233 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 
307 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  32.18 
 
 
624 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  31.48 
 
 
616 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  32.58 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.19 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.4 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  30.84 
 
 
218 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  34.78 
 
 
217 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  34.78 
 
 
217 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  34.24 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  30.89 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  32.39 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.39 
 
 
219 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  38.41 
 
 
311 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  32.39 
 
 
217 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  38.41 
 
 
311 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.21 
 
 
553 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
228 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
876 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  31.67 
 
 
217 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  31.67 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
313 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 
179 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
210 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 
224 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
227 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35.76 
 
 
311 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.63 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  28.57 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36 
 
 
398 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  33.71 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  31.82 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.02 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  29.38 
 
 
209 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.02 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 
182 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>