More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3327 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  83.2 
 
 		 253 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  38.77 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.09 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  40.94 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36 
 
 		 349 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.73 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.24 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  33.91 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  32.53 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  32.53 
 
 		 220 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 335 aa  98.6  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  38.93 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 		 224 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  33.7 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  31.74 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  33.7 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 354 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 		 671 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.12 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.82 
 
 		 671 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.36 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 228 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  32.61 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  37.5 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.89 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  29.87 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  39.55 
 
 		 671 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  30.94 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  31.3 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  23.31 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  32.58 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  32.58 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.46 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  24.02 
 
 		 216 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  23.31 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  24.15 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  23.58 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  23.31 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  23.31 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.24 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  23.14 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  22.88 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  22.88 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  34.39 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  32.03 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 		 664 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  36.67 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.38 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>