286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0173 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  79.55 
 
 		 220 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  58.38 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  47.09 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  48.36 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  48.36 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  48.36 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  46.48 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 		 313 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  50.58 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  43.44 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  40.79 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  46.43 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  43.5 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  47.77 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.85 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  43.66 
 
 		 624 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 		 348 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  30.82 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  39.58 
 
 		 349 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  32.28 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  34.57 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  39.38 
 
 		 600 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.63 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  43.4 
 
 		 616 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  46.38 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  40.12 
 
 		 652 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  40.96 
 
 		 354 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  40.99 
 
 		 652 aa  98.2  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  37.82 
 
 		 335 aa  98.2  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  47.48 
 
 		 629 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.88 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 876 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  38.92 
 
 		 173 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 173 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  41.73 
 
 		 671 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  41.73 
 
 		 671 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  41.73 
 
 		 671 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  39.86 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  31.65 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  40.12 
 
 		 553 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  36.88 
 
 		 182 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  41.13 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  38.78 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  37.16 
 
 		 630 aa  81.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  41.56 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 664 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  33.73 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  33.73 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  33.73 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 		 613 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 		 613 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 		 613 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.38 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  36.48 
 
 		 172 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 617 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>