261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2628 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  96.26 
 
 		 214 aa  400  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  58.14 
 
 		 228 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  56.28 
 
 		 313 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  56.28 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  55 
 
 		 234 aa  216  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  53.46 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  53.92 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  53.46 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  55.74 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  55.14 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  55.14 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  55.14 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  48.74 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  45.95 
 
 		 237 aa  171  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  51.46 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  47.43 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  44.32 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  48.54 
 
 		 174 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  47.92 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  40.99 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  41.84 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  37.11 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  29.25 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  32.96 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  35.54 
 
 		 624 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 876 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 671 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 336 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 671 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 348 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.69 
 
 		 349 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  36.71 
 
 		 664 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.69 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 349 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.26 
 
 		 671 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.47 
 
 		 553 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 339 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.66 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  30.7 
 
 		 613 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  30.7 
 
 		 613 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  30.7 
 
 		 613 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  27.1 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  38.61 
 
 		 616 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35.23 
 
 		 600 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  33.5 
 
 		 630 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.92 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  37.65 
 
 		 652 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  31.46 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  36.47 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  40.52 
 
 		 629 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.15 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.15 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.54 
 
 		 398 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>