255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 174 aa  353  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  64.74 
 
 		 237 aa  221  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  54.39 
 
 		 235 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  57.23 
 
 		 229 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  59.52 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  58.14 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  55.49 
 
 		 219 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  56.14 
 
 		 234 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  50.28 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  53.8 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  53.8 
 
 		 313 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  52.3 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  53.8 
 
 		 228 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  52.3 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  51.72 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  50.58 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  50.58 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  50.87 
 
 		 220 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  54.71 
 
 		 226 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  48.54 
 
 		 214 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  48.82 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  41.86 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 219 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 219 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  38.78 
 
 		 204 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  33.14 
 
 		 221 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  32.24 
 
 		 208 aa  91.3  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 265 aa  90.5  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  36.36 
 
 		 553 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 212 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 247 aa  86.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  36.69 
 
 		 336 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  33.58 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  31.1 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 671 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  35.46 
 
 		 624 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 671 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 253 aa  81.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.81 
 
 		 671 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.82 
 
 		 349 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 		 664 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.46 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 339 aa  77.4  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  32.42 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  30.41 
 
 		 276 aa  74.3  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  35.92 
 
 		 613 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  35.92 
 
 		 613 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  31.25 
 
 		 390 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  35.92 
 
 		 613 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  35.04 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  36.5 
 
 		 876 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 		 616 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  30 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  31.37 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  28.37 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 335 aa  71.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  33.58 
 
 		 630 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  34.75 
 
 		 617 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35.34 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.81 
 
 		 279 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.25 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  34.75 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>