More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0475 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  99.67 
 
 		 613 aa  1214    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  77.38 
 
 		 617 aa  891    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  99.67 
 
 		 613 aa  1214    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  77.25 
 
 		 617 aa  914    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 613 aa  1221    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  57.12 
 
 		 630 aa  611  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  56.04 
 
 		 876 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  47.9 
 
 		 624 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  47.72 
 
 		 616 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  45.07 
 
 		 600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  41.77 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  39.36 
 
 		 652 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  39.19 
 
 		 652 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  42.99 
 
 		 470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 		 465 aa  319  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  42.96 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  38.77 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  37.24 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  37.68 
 
 		 436 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  37.68 
 
 		 451 aa  258  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  40.69 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  42.42 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  34.38 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  34.56 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  33.99 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.87 
 
 		 391 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  34.78 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  34.96 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  37.3 
 
 		 391 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 389 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 389 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  36.5 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.53 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.24 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  35.4 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  37.76 
 
 		 457 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  35.49 
 
 		 402 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.05 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  36.67 
 
 		 438 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.13 
 
 		 390 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  35.78 
 
 		 475 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  35.13 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  35.56 
 
 		 449 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  35.07 
 
 		 456 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.12 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  34.6 
 
 		 450 aa  223  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  34.39 
 
 		 453 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  35.89 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.88 
 
 		 389 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  34.15 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  33.58 
 
 		 391 aa  220  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  35.71 
 
 		 451 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.63 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.62 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.37 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.15 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  36.27 
 
 		 423 aa  217  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  36.88 
 
 		 446 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.41 
 
 		 391 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 388 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 434 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 		 427 aa  214  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.6 
 
 		 398 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.05 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  34.24 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.89 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  32.77 
 
 		 624 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.54 
 
 		 391 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  38.29 
 
 		 414 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  35.13 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.32 
 
 		 382 aa  210  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  34.55 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  34.32 
 
 		 383 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.36 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.16 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.58 
 
 		 392 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  39.06 
 
 		 392 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  29.77 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  34.74 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.95 
 
 		 401 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.72 
 
 		 399 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.1 
 
 		 391 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  31.5 
 
 		 379 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.84 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  32.13 
 
 		 386 aa  205  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.73 
 
 		 397 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  36.53 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.53 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.58 
 
 		 391 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>