167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  37.7 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  41.1 
 
 
252 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  39.43 
 
 
270 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  38.17 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  29.96 
 
 
246 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  39.18 
 
 
238 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.35 
 
 
330 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
291 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.04 
 
 
247 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  34.34 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  27.66 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
256 aa  92  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  40.26 
 
 
192 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  28.15 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  33.72 
 
 
264 aa  89  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.99 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 
276 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  33.14 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  27.73 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.52 
 
 
349 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  31.9 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  30.09 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  29.81 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  30.06 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  29.31 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  30.41 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  27.2 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  26.4 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 
220 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
268 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.64 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  25.31 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  25.09 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 
226 aa  59.7  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  29.8 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  24.9 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
354 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.92 
 
 
219 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 
335 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  27.16 
 
 
624 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  24.84 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
228 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 
230 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 
217 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  32.23 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  30.26 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  26.28 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  26.28 
 
 
216 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  24.84 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  24.84 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
671 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  33.1 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>