269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3635 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  86.83 
 
 
182 aa  297  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  49.1 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  45.78 
 
 
624 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
179 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  41.76 
 
 
173 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
876 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  45.88 
 
 
652 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  45.29 
 
 
652 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  44.03 
 
 
188 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  43.95 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  42.69 
 
 
616 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  46.75 
 
 
629 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  40 
 
 
553 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  37.64 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  43.54 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  43.12 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  38.12 
 
 
617 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  40.74 
 
 
600 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  37.13 
 
 
179 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  37.7 
 
 
617 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  37.43 
 
 
630 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  36.97 
 
 
173 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
249 aa  104  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  35.91 
 
 
613 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  35.91 
 
 
613 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  35.91 
 
 
613 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
339 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.39 
 
 
349 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
348 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 
671 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 
671 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
349 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 
664 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
265 aa  95.9  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.37 
 
 
671 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
313 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 
268 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
269 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  31.17 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
247 aa  92.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 
240 aa  92  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  36.08 
 
 
624 aa  92  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
263 aa  90.9  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
354 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
265 aa  84.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
335 aa  84.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 
307 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  36.96 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  39.08 
 
 
644 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
250 aa  81.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
246 aa  77.8  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.55 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  33.14 
 
 
627 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  34.71 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
251 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.82 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  34.39 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  32.62 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  29.81 
 
 
390 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  30.99 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.65 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  24.44 
 
 
239 aa  63.5  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
231 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
267 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>