More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1802 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 876 aa  1694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  55.57 
 
 		 624 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  55.59 
 
 		 617 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  55.88 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  55.88 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  56.06 
 
 		 613 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  55.99 
 
 		 617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  56.51 
 
 		 616 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  52.54 
 
 		 630 aa  549  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  53.91 
 
 		 600 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  48.01 
 
 		 652 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  48.74 
 
 		 629 aa  482  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  46.57 
 
 		 652 aa  469  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  49.07 
 
 		 470 aa  366  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  49.88 
 
 		 465 aa  362  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  51.49 
 
 		 426 aa  337  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  45.77 
 
 		 455 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  50.88 
 
 		 481 aa  323  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  44.99 
 
 		 404 aa  289  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 394 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  40.6 
 
 		 450 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  38.61 
 
 		 446 aa  287  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.78 
 
 		 455 aa  287  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.84 
 
 		 391 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  45.57 
 
 		 445 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  40.83 
 
 		 472 aa  281  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.61 
 
 		 389 aa  281  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 389 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.63 
 
 		 396 aa  278  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 389 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  40.32 
 
 		 451 aa  277  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  37.32 
 
 		 444 aa  277  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 389 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.12 
 
 		 389 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.1 
 
 		 389 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  40.51 
 
 		 436 aa  277  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 389 aa  277  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 389 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.38 
 
 		 391 aa  275  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.44 
 
 		 438 aa  274  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  40.66 
 
 		 452 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  39.56 
 
 		 456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  42.92 
 
 		 423 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.13 
 
 		 391 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  38.81 
 
 		 449 aa  270  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  40.09 
 
 		 453 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  40.09 
 
 		 453 aa  268  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.24 
 
 		 391 aa  267  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.28 
 
 		 409 aa  267  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  38.89 
 
 		 444 aa  266  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  40.35 
 
 		 468 aa  266  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.71 
 
 		 390 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.01 
 
 		 391 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.28 
 
 		 398 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  38.79 
 
 		 451 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  43.75 
 
 		 392 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  34.58 
 
 		 435 aa  260  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.96 
 
 		 392 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.14 
 
 		 391 aa  258  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  36.78 
 
 		 475 aa  258  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  37.09 
 
 		 450 aa  258  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  40.23 
 
 		 453 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  41.49 
 
 		 414 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  39.06 
 
 		 446 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  43.56 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.25 
 
 		 382 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  41.95 
 
 		 446 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  40.75 
 
 		 438 aa  254  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  39.86 
 
 		 402 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 399 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  34.05 
 
 		 395 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  36.59 
 
 		 452 aa  253  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 388 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.56 
 
 		 382 aa  251  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 388 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 388 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 388 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.81 
 
 		 398 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.05 
 
 		 388 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.9 
 
 		 391 aa  251  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40.83 
 
 		 424 aa  250  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  39.02 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.83 
 
 		 399 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  39.51 
 
 		 401 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  41.2 
 
 		 460 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.97 
 
 		 430 aa  249  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  38.46 
 
 		 451 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 388 aa  248  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.86 
 
 		 391 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.66 
 
 		 400 aa  247  9e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  36.72 
 
 		 514 aa  246  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.77 
 
 		 394 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>