234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0747 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
335 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  35.17 
 
 
240 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 
253 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  37.35 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
242 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
265 aa  96.3  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
265 aa  89.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
263 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 
671 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 
671 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 
232 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  38.93 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.44 
 
 
671 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 
246 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  32.65 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 
182 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  34.53 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  36.3 
 
 
227 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  32.41 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  32.41 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  32.41 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
220 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.77 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.81 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.67 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.52 
 
 
624 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.7 
 
 
616 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.41 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
219 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.61 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.93 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35.4 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 
876 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  34.21 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  35.66 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  32.05 
 
 
174 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
262 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  34 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
221 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  33.52 
 
 
652 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 
219 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
221 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.41 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 
254 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
182 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 
248 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
243 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
228 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
179 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
251 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 
172 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  32.95 
 
 
617 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  31.91 
 
 
261 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
227 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>