289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2771 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  43.48 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  43.94 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.98 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  40.21 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  39.86 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  34.35 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.62 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  33.63 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  33.63 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  33.63 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  34.95 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  38.92 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 		 339 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.61 
 
 		 553 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.91 
 
 		 349 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  39.26 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  41.04 
 
 		 616 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.25 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.88 
 
 		 671 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  35.76 
 
 		 624 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.89 
 
 		 876 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.03 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.82 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  25.82 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  25.82 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  25.82 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  40.67 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  28.38 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.83 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  24.41 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  24.41 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  31.76 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  31.76 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.67 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  35.03 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  24.2 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  38.29 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 664 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  23.94 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  33.52 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  39.19 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  23.94 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>