286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0018 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  53.73 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  47.64 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  41.34 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  41.78 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  46.47 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.15 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 220 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 		 251 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 221 aa  92.4  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  36.49 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  36.49 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 214 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 247 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.07 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 664 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 		 671 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 671 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  30.65 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  30.65 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.52 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.65 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  29.65 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  29.65 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.65 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  29.65 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.59 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.07 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  28.08 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.67 
 
 		 624 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  34.97 
 
 		 616 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  29.09 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.78 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  28 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.38 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35.1 
 
 		 600 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  28 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 173 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>