270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3685 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  64.12 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  59.79 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  59.78 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  59.67 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  58.05 
 
 		 222 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  56.98 
 
 		 197 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  55.98 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  50.28 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  46.75 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.95 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.95 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  45.56 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  45.56 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  45.61 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  44.97 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  44.25 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  35.88 
 
 		 252 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  34.3 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  35.88 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  36.16 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.31 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  31.49 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 255 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  35.17 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 255 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 247 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  34.88 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  34.88 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  34.03 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  32.3 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  35.95 
 
 		 268 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  30.27 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 247 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 266 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 275 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  26.55 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 269 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 262 aa  84.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.44 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.91 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.44 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  29.44 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.53 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  29.44 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  26.83 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  33.95 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 535 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.15 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.78 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  34.12 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>