More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1143 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
221 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  59.8 
 
 
220 aa  266  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  41.45 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  46.55 
 
 
214 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  41.67 
 
 
226 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 
247 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
263 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 
265 aa  136  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  38.82 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.86 
 
 
349 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
349 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 
242 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
339 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 
335 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
269 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
254 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 
241 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 
228 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
251 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.85 
 
 
275 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 
279 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 
354 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.64 
 
 
216 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.14 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
243 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.63 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
299 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.63 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 
293 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  31.82 
 
 
218 aa  92  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.53 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  34.52 
 
 
218 aa  91.7  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
262 aa  91.7  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  30.57 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.13 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25.13 
 
 
217 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  25.13 
 
 
216 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
253 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.63 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
281 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  29.41 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  24.06 
 
 
616 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  27.33 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.44 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  30.72 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.2 
 
 
553 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.79 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.61 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  23.11 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  29.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  29.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 
664 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  25.98 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  32.47 
 
 
276 aa  72  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.82 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  27.68 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  27.68 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  27.39 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  27.63 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.94 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.41 
 
 
876 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2972  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  26.42 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.490443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  30.57 
 
 
629 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>