236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1292 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  75.97 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  45.63 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  45.24 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  42.77 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.08 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  38.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  37.04 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 335 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 664 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 		 354 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 		 671 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 		 671 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  31.36 
 
 		 226 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  36.99 
 
 		 553 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.21 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.74 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38.41 
 
 		 671 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.52 
 
 		 624 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.74 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  30.91 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  31.25 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.94 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  28.65 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.38 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  39.76 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  26.22 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  26.35 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  30.5 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.36 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.9 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  23.43 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  27.57 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  34.84 
 
 		 652 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  25.61 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  28.65 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  26.26 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  26.29 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 876 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>