147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0955 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  45.52 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.64 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  33.07 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.74 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.82 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.92 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  31.2 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.5 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  33.19 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.08 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  31.22 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  31.98 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  31.72 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  39.18 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  28.64 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  28.26 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  29.76 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  33.13 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  33.13 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  33.13 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.23 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  34.27 
 
 		 566 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  36.08 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.85 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  29.89 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.15 
 
 		 553 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  30.3 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.06 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  30.56 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  28.26 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  24.56 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  27.88 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  29.13 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.88 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  32.96 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  28.93 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  23.91 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  29.12 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.49 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.95 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  34.29 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  22.48 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  27.04 
 
 		 624 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 664 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.28 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>