55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 
276 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  32.6 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  31.27 
 
 
296 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
291 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.23 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  43.62 
 
 
316 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  30.14 
 
 
279 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 
237 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.49 
 
 
252 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  36.46 
 
 
277 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  33.72 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
312 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.08 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.18 
 
 
192 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  27.94 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32.69 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  32.1 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.69 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  33.12 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  28.06 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  27.39 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  26.07 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  29.51 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  30 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  28.38 
 
 
240 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  26.53 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  30.19 
 
 
566 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  28.83 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  24.62 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  24.3 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  30.3 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  23.47 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  25.44 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  25.44 
 
 
199 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  21.6 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1999  glutaredoxin, putative  25.77 
 
 
198 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>