141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1120 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  81.78 
 
 		 237 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  51.41 
 
 		 192 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.78 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  38.17 
 
 		 276 aa  128  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  36.04 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  32.84 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  32.23 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  40.41 
 
 		 291 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 		 296 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  31.06 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  36.05 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  31.28 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  29.26 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 316 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.69 
 
 		 330 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.16 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.16 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.16 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  34.97 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.23 
 
 		 307 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  28.78 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  35.63 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  40.69 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  36.09 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  31.79 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  27.97 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  29.8 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  31.22 
 
 		 319 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  40.43 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  27.48 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.21 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  30.5 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.4 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  24.37 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  33.61 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  31.36 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  31.64 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.54 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  27.38 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.29 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.66 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.48 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  31.88 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  22.65 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  23.49 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 664 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 354 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 		 876 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  21.2 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  26.16 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>