56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12984 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  60.73 
 
 
257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  60.73 
 
 
257 aa  311  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  61.96 
 
 
252 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  61.96 
 
 
252 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  61.96 
 
 
252 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  39.01 
 
 
244 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  32.08 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  39.39 
 
 
307 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.08 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  40 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  26.92 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  33.12 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  31.46 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  34.09 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  30.19 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  30.43 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  27 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  26.03 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  27.7 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  31.86 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  29.67 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  30.82 
 
 
319 aa  62.8  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.55 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.06 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  28.72 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  28.72 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  26.01 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  28.32 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  26.06 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  25.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  25.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  25.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
339 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  22.71 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
228 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  26.11 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>