64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1987 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  71.84 
 
 
257 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  71.84 
 
 
257 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  61.96 
 
 
255 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  40.8 
 
 
244 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.91 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.42 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  32.1 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  34.84 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  36.24 
 
 
276 aa  85.5  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  31.79 
 
 
566 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  34.21 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  34.66 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  38.1 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  32.54 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  26.91 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  28.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  28.5 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  27.64 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  27.07 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 
316 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.56 
 
 
319 aa  58.9  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  26.09 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.4 
 
 
330 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  27.67 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  21.88 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  26.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  26.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  26.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
313 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  27.11 
 
 
279 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  27.69 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 
231 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  28.96 
 
 
326 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.1 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.24 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  26.27 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 
268 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 
232 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>