248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0700 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  53.26 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  53.26 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  53.26 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  49.19 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  49.73 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  52.91 
 
 		 214 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  52.63 
 
 		 220 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  50 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  48.86 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  48.42 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  48.26 
 
 		 214 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  48.86 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  47.4 
 
 		 229 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  46.02 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  46.02 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  42.78 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  41.3 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  42.16 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  42.21 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  39.55 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  41.38 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  38.27 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  37.5 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  40.7 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  32.73 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  35.39 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  32.73 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.21 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  37.5 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  38.99 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.36 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  33.71 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  41.77 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  30.53 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  31.98 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  34.41 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  35.26 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  27.85 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  26.2 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.89 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  26.07 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.9 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.4 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.06 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  24.78 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.78 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 335 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  29.89 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  29.89 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.41 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  26.64 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  28.43 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  26.11 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1777  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.176727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>