42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0755 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  49.53 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  49.52 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  28.44 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  29.83 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  29.94 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  25.93 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  26.4 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.56 
 
 
257 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.12 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  30.77 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.47 
 
 
307 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  27.17 
 
 
323 aa  55.1  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  26.18 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.59 
 
 
192 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
275 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  29.2 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  29.2 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  29.2 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  29.51 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0449  hypothetical protein  25.21 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.308397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.66 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  25.13 
 
 
319 aa  45.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  35.38 
 
 
337 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
312 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  28.18 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  28.57 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  27.83 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.65 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  22.6 
 
 
254 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 
316 aa  41.6  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>