79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0449 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0449  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.308397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  32.46 
 
 
218 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  34.44 
 
 
218 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  22.91 
 
 
217 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  22.91 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  22.91 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  22.91 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  22.91 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  23.64 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  24.06 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  22.35 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  21.79 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1999  glutaredoxin, putative  22.99 
 
 
198 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  22.35 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  22.35 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  25.52 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  24.68 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.59 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.52 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  22.34 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  22.92 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  19.16 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  19.16 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  24.67 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2972  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  21.05 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.490443  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  25.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  25.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  25.21 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  23.17 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  25.89 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  37.5 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  21.28 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  20.1 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  21.65 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  27.74 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  20.79 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  37.5 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.58 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  26.38 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  23.43 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  22.65 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  22.11 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  23.63 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  20.69 
 
 
263 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  22.53 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  22.47 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.29 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.29 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  32.31 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  20.38 
 
 
256 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  36.96 
 
 
217 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
211 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  36.96 
 
 
217 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>