100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1999 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1999  glutaredoxin, putative  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  57.65 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  57.65 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  31.4 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30.81 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  31.98 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.54 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  31.4 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  29.79 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  29.28 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  29.28 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0449  hypothetical protein  22.99 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.308397  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  21.29 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  24.58 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  22.98 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  20.11 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  21.64 
 
 		 241 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  18.62 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  21.18 
 
 		 268 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  20.48 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  23.26 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.42 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  24.24 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  21.47 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  22.22 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  40.91 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  20.75 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  25.3 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  24.24 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  23.17 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  23.12 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  43.48 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  23.9 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  23.9 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  22.56 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  37.04 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  22.94 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  22.94 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.44 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  22.94 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  21.14 
 
 		 671 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  21.14 
 
 		 671 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.29 
 
 		 244 aa  44.7  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  26.23 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  27.61 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  23.3 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.09 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  21.71 
 
 		 671 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  29.63 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  27.17 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  25.77 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  23.2 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  23.08 
 
 		 652 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  22.6 
 
 		 335 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  22 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  23.03 
 
 		 246 aa  42  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  22.29 
 
 		 238 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 267 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  26.73 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  21.57 
 
 		 298 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>