More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1102 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  62.56 
 
 
222 aa  256  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  67.63 
 
 
197 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  54.98 
 
 
217 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  62.65 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  60.34 
 
 
236 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  61.73 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  56.04 
 
 
211 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  42.58 
 
 
210 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  40.67 
 
 
210 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  44.25 
 
 
204 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  44.25 
 
 
204 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
210 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  43.6 
 
 
211 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  44.75 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  43.1 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  42.44 
 
 
211 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  41.86 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 
209 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  40.21 
 
 
243 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  40.21 
 
 
243 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  41.08 
 
 
198 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  35.1 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.76 
 
 
253 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
259 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 
255 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
252 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
260 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
252 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  32.04 
 
 
252 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
255 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  32.04 
 
 
252 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  37.13 
 
 
257 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  38.86 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  38.86 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 
263 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 
247 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.68 
 
 
247 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 
255 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  32.61 
 
 
274 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 
250 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  34.78 
 
 
261 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  34.78 
 
 
261 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 
257 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
255 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
269 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 
205 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
255 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 
254 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 
268 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 
266 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  32.9 
 
 
246 aa  98.6  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 
247 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  34.5 
 
 
254 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 
248 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
250 aa  92  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 
262 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.06 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.06 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  30.34 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  28.57 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  29.06 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  29.06 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  25.97 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
288 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  32.91 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  30.63 
 
 
671 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.36 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>