More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0881 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 
236 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 
220 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 
219 aa  153  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
265 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
247 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 
231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.33 
 
 
349 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
268 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
348 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
251 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  36.31 
 
 
279 aa  111  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 
339 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 
254 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 
232 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
232 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
242 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
293 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
263 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  32.94 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
335 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
354 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
248 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
228 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
299 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
269 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.18 
 
 
553 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.41 
 
 
275 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  32.77 
 
 
233 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
251 aa  88.2  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.4 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.93 
 
 
282 aa  85.1  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  27.87 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  28.26 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  30.95 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 
281 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  31.64 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  30.99 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  30.64 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  31.08 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  31.08 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  31.08 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  31.08 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  27.6 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  30.41 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  30.41 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.03 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  29.94 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.45 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  30.46 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.29 
 
 
244 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.73 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30.41 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.73 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.8 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.33 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  28.86 
 
 
284 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  30.49 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  29.19 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  28.5 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.02 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>