167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1140 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  40.51 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 265 aa  95.1  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 		 339 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.46 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.73 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 354 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.99 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  33.12 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  23.79 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  25.46 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  23.88 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  23.5 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  23.88 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  23.88 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  23.88 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  23.38 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  21.98 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.43 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  23.88 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  24.4 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.98 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  23 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 671 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 671 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  28.36 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  28.36 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.21 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  23.42 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  22.5 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  27.88 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 664 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  25.5 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  25.5 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.68 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  33.61 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  23.72 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.33 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  25.61 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  24.02 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  28.07 
 
 		 671 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  19.05 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  25.26 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0449  hypothetical protein  21.53 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.308397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  28.42 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  22.94 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  23.6 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  24.03 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  21.64 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>