More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1644 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 262 aa  546  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  66.13 
 
 		 263 aa  362  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  37.08 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.08 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  40.24 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  33.52 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 335 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.59 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 671 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 671 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 664 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  36.88 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  32.4 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  35.75 
 
 		 220 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.94 
 
 		 671 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  38.36 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 293 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  34.64 
 
 		 220 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  31.32 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.08 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 219 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  31.7 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.44 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  31.25 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  33.89 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  33.71 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 179 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.14 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.37 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  34.27 
 
 		 398 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  31.65 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  29.66 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.43 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.8 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  32.8 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 876 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  32.8 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  33.33 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.58 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  33.69 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  29.01 
 
 		 616 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>