202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0014 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  38.55 
 
 		 247 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  36.69 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  35.06 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  34.52 
 
 		 247 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  35.75 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.34 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  34.68 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  32.58 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  33.92 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  35.33 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  35.93 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  32.9 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  33.77 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  33.12 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  34.1 
 
 		 247 aa  96.3  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  35.67 
 
 		 219 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  31.98 
 
 		 217 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 335 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 240 aa  92.8  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.54 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.98 
 
 		 671 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 664 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.13 
 
 		 624 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  35.54 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 876 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  33.99 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  35.54 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  30.85 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  35.37 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.91 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.94 
 
 		 652 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25.9 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  31.94 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.41 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  32.64 
 
 		 629 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  26.67 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  27.97 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  30.07 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  28.77 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.34 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.22 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.48 
 
 		 553 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  29.33 
 
 		 617 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>