164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  95.28 
 
 		 217 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  54.76 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  52.63 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  50.29 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  48.52 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  48.21 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  42.2 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  47.34 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  42.11 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  44.91 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  40.2 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  44.97 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  44.09 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  44.97 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  44.91 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  47.34 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  38.37 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  38.95 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  39.36 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  36.94 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 276 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  85.96 
 
 		 59 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.35 
 
 		 652 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.49 
 
 		 652 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  31.43 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 671 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 671 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  28.41 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.88 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.73 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.57 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  28.49 
 
 		 671 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.65 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 269 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 339 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 876 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 348 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.59 
 
 		 349 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 307 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.35 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.51 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  53.19 
 
 		 89 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  31.58 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  24.43 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.66 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  23.81 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.66 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.58 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  23.81 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.48 
 
 		 624 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 173 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  24.12 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  27.03 
 
 		 262 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  23.21 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  26.67 
 
 		 600 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  31.91 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  25.39 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>