95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0857 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  80.62 
 
 		 228 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  52.3 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  46.93 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  50.58 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  49.13 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  44.33 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  45.18 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  49.42 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  47.49 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  47.78 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  48.24 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  48 
 
 		 254 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  47.49 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  45.61 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  45 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  42.77 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  41.04 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.06 
 
 		 286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  30.27 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  50.98 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24.29 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  27.22 
 
 		 652 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.63 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  28.97 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.8 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 348 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  25.28 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.45 
 
 		 349 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  46.94 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 354 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.82 
 
 		 652 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.75 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 664 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.4 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  43.9 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.2 
 
 		 313 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 179 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  26.63 
 
 		 390 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  23.78 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  23.78 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  23.78 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  23.49 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  23.6 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  38.6 
 
 		 89 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  21.23 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  27.81 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.81 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 255 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 232 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 265 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  23.57 
 
 		 218 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  26.25 
 
 		 264 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>