98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2185 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  95.95 
 
 
247 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  94.33 
 
 
247 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  68.13 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  61.26 
 
 
254 aa  274  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  53.2 
 
 
254 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  58.56 
 
 
254 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  57.2 
 
 
247 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  57.21 
 
 
245 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  59.41 
 
 
261 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  59.18 
 
 
254 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  57.14 
 
 
236 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  47.69 
 
 
225 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  45.93 
 
 
246 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  51.72 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  41.77 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  44.1 
 
 
244 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  43.01 
 
 
241 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  44.38 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  42.86 
 
 
217 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.1 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
257 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
276 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 
335 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  26.07 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  43.53 
 
 
671 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  42.35 
 
 
671 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 
339 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
179 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  46 
 
 
671 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 
229 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.57 
 
 
232 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.94 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  30.29 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  32.35 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  30.29 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
348 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
664 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.74 
 
 
652 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  33.85 
 
 
652 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  29.71 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  25.61 
 
 
390 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.66 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.09 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
220 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
349 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
262 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.28 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  23.31 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  43.84 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
281 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  26.86 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  30.63 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  28.4 
 
 
311 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
225 aa  45.4  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  40.24 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.29 
 
 
553 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  40 
 
 
59 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.04 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  28.77 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  42.47 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  25.69 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  23.6 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  20.2 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.82 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
226 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  25.24 
 
 
227 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
211 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
270 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>