93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2860 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  57.03 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  62.05 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  59.07 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  55.7 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  57.2 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  54.5 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  56.16 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  54.19 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  52.27 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  49.04 
 
 		 225 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  54.76 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  43.95 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  46.55 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  45.67 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  52.3 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  46.51 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  38.55 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  45.88 
 
 		 219 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 348 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.02 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 182 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 		 313 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.7 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.87 
 
 		 652 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.31 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  24.69 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  24.69 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  24.69 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  24.69 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  24.69 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  29.75 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 664 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.33 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.25 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  23.42 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4638  hypothetical protein  24.36 
 
 		 342 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  23.26 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  24.49 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  23.86 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.58 
 
 		 652 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 671 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  43.59 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  24.85 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 671 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  44.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  21.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  34 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1174  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.51 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  29.25 
 
 		 624 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  27.39 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.41 
 
 		 390 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  28.78 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  32.67 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  23.57 
 
 		 409 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  38.16 
 
 		 217 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  29.85 
 
 		 398 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  38.16 
 
 		 217 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  43.14 
 
 		 59 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.93 
 
 		 220 aa  42  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>