96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1440 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 228 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0857  hypothetical protein  80.62 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.473961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2860  hypothetical protein  53.67 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36300  DSBA oxidoreductase  49.43 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0684  DSBA oxidoreductase  50.87 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3425  hypothetical protein  42.53 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1397  hypothetical protein  48.13 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2395  hypothetical protein  50.87 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0527656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59960  putative protein-disulfide isomerase  51.74 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.374938  hitchhiker  0.00000000711026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  49.19 
 
 		 254 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4517  putative protein-disulfide isomerase  50.29 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  46.46 
 
 		 254 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4180  hypothetical protein  46.74 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0236736  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0501  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1183  hypothetical protein  49.42 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0947  hypothetical protein  45.75 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1623  hypothetical protein  44.38 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2185  hypothetical protein  51.45 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1768  protein-disulfide isomerase-like protein  42.11 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00864718  hitchhiker  0.000943846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4096  hypothetical protein  40.35 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.75 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 276 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4051  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4519  dsba oxidoreductase  54.9 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  23.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.68 
 
 		 652 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  24.73 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.67 
 
 		 652 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.09 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.15 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 313 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.14 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 335 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36550  hypothetical protein  41.27 
 
 		 89 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.93 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  26.92 
 
 		 390 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0862  DSBA oxidoreductase  25.58 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00262563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  43.28 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  26.62 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 664 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  24.45 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  24.9 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  36.99 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.05 
 
 		 349 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  29.8 
 
 		 629 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30.49 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25.28 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.83 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  35 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.9 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 671 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  21.23 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 263 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  24.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  21.23 
 
 		 257 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  33.96 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.49 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 335 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>