29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4120 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  320  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  89.38 
 
 
160 aa  289  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  88.75 
 
 
160 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  85 
 
 
161 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  63.52 
 
 
162 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  68.66 
 
 
165 aa  193  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  68.66 
 
 
165 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  68.66 
 
 
162 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  68.66 
 
 
162 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  68.66 
 
 
162 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  67.91 
 
 
162 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  50.35 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  50.35 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  47.4 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  29.49 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  28.57 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  29.17 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  27.85 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1011  hypothetical protein  68 
 
 
53 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00188665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  30.6 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  25.32 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  31.53 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  20.89 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  26.96 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  26.79 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0971  hypothetical protein  73.53 
 
 
34 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal  0.142812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 
228 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  19.23 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  32.91 
 
 
368 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>