More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4145 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  319  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  41.5 
 
 
170 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  44.17 
 
 
173 aa  120  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1906  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.41 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.82 
 
 
374 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  33.64 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.38 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  27.66 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  33.64 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  37.5 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  47.46 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.69 
 
 
194 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  40.62 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  32.71 
 
 
193 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  32.71 
 
 
193 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  24 
 
 
377 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.7 
 
 
194 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  39.06 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  47.17 
 
 
311 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  39.06 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.06 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.96 
 
 
223 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.06 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.67 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  39.68 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  35.24 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  27.73 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  33.04 
 
 
211 aa  58.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.61 
 
 
194 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 
183 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  29.27 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  28.36 
 
 
191 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.06 
 
 
202 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  29.59 
 
 
182 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  27.4 
 
 
238 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  30.85 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.04 
 
 
191 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
194 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  28.1 
 
 
187 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  38.96 
 
 
183 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  34.18 
 
 
223 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
306 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.25 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.06 
 
 
198 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  48.98 
 
 
209 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.18 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.62 
 
 
409 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  34.04 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.52 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  34.25 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  36.99 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  42.22 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.69 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.21 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  31.78 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  35.35 
 
 
455 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  31.78 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  24.14 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  31.78 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  31.78 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
306 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  38.98 
 
 
193 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  31.78 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  32.99 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  29.03 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  28.46 
 
 
238 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  27.61 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  43.1 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  31.78 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  41.27 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  30.33 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  28.18 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  32.04 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  33.68 
 
 
200 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  31.78 
 
 
202 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  28.57 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  34.04 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  30.95 
 
 
310 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  33.33 
 
 
280 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.69 
 
 
238 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  43.18 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  29.47 
 
 
183 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  33.33 
 
 
269 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  27.52 
 
 
183 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.7 
 
 
185 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
195 aa  53.9  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  27.52 
 
 
182 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  27.52 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>