More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1906 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1906  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  31.41 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  41.24 
 
 
377 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  34.96 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  33.61 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  29.69 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  35.14 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
374 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  34.86 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  33.94 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  35.96 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  31.53 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  26.45 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  32.74 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  31.71 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  32.74 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  36.7 
 
 
183 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  32.74 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  32.74 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
186 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
186 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  32.74 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  32.08 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  38.95 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  34.23 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.82 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  35.05 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.54 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  38.95 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.94 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  38.95 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  33.61 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  35.4 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  30.28 
 
 
269 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  30.88 
 
 
269 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  31.48 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.82 
 
 
191 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.46 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  35.71 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  29.11 
 
 
248 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  35.24 
 
 
195 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  33.63 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.14 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  32.48 
 
 
220 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  32.89 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.06 
 
 
433 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  27.43 
 
 
175 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  31.03 
 
 
194 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.63 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  30.97 
 
 
269 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.11 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  32.24 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  28.45 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.69 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.69 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  27.73 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.58 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  34.04 
 
 
133 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.84 
 
 
447 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  32.46 
 
 
269 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  28.23 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  32.76 
 
 
224 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.36 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  33.01 
 
 
209 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  33.63 
 
 
193 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.89 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  31.25 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  28.07 
 
 
197 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  32.98 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
269 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.77 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.19 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  35.71 
 
 
173 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  33.64 
 
 
223 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  27.13 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  31.09 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  36.46 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  25.66 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  33.64 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.02 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  29.92 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>