More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3701 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  100 
 
 
155 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  98.06 
 
 
155 aa  313  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4227  thioredoxin, putative  67.11 
 
 
155 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0895869  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1646  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.36 
 
 
154 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1248  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.36 
 
 
154 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4071  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.71 
 
 
154 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65049  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.36 
 
 
154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  61.03 
 
 
156 aa  186  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.41 
 
 
152 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00388895  normal  0.0679013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51930  thioredoxin  56.67 
 
 
154 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4555  thioredoxin  54.3 
 
 
154 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  37.25 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  31.72 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  31.72 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
184 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2483  redoxin  33.12 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  37.4 
 
 
189 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02142  Thioredoxin related protein  32.8 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0646766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1049  thioredoxin  30.77 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  32.81 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
183 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  34.38 
 
 
183 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.33 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  34.38 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.8 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.35 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.27 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  32.56 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.05 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.89 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  30.65 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  33.59 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  33.05 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  33.85 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  33.85 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  34.45 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.05 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  33.85 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  33.85 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  33.85 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  33.85 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  33.85 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  30.77 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  34.26 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  33.85 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  33.04 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  36.13 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  31.09 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  31.93 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  35.94 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  30.53 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  31.13 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  31.58 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  25.41 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  23.49 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  33.63 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  26.67 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.78 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  29.29 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  26.61 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  27.34 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  30.28 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.65 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.63 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.69 
 
 
437 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
446 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  30.09 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  30.36 
 
 
433 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>