More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0478 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  97.71 
 
 
306 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  96.41 
 
 
306 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  85.2 
 
 
305 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  85.2 
 
 
332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  84.21 
 
 
316 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  84.21 
 
 
316 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  34.29 
 
 
311 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.3 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.45 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1064  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.39 
 
 
361 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.63 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
188 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.24 
 
 
166 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  29.2 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.3 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  31.71 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  28.22 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  34.86 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  31.09 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  37.27 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  27.85 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  34.62 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.07 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  34.38 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  34.38 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  34.38 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  27.27 
 
 
172 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  34.38 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  33.07 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  31.91 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  33.07 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.91 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  26.22 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.84 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.65 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.93 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.56 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  33.33 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  28.4 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  33.59 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.38 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  33.59 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.02 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.38 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.29 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  26.95 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  30.48 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  28.06 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  30.48 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  32.97 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  31.19 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  28.7 
 
 
155 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  29.32 
 
 
173 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  34.69 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.27 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  27.97 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  32.74 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  33.02 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  33.02 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  30.16 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
189 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  33.02 
 
 
155 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  28.48 
 
 
165 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  34.58 
 
 
164 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.11 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  35.24 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
189 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  31.87 
 
 
179 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
193 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.04 
 
 
169 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.5 
 
 
223 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  35.87 
 
 
165 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  35.87 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>