132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4532 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  57.14 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  55.7 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  31.61 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  33.12 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  29.63 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  30.56 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  34.62 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  27.71 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  28.74 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  28.05 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  25.95 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  25.62 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.5 
 
 		 374 aa  65.1  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  27.44 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  28.75 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  29.31 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  28.45 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  25.9 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  27.83 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  27.83 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  27.83 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  27.83 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  29.36 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  29.36 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  26.79 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  21.3 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.69 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  29.32 
 
 		 377 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 		 209 aa  50.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  46.51 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  36.11 
 
 		 278 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  25.2 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  28.45 
 
 		 198 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  24.84 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  26.83 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3383  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.42 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  45.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0664  redoxin domain-containing protein  32.08 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  30.12 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.43 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13488  hypothetical protein  30.63 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.89 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  30.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  28.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  32.18 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.87 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  32.18 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  28.04 
 
 		 368 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4669  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.53 
 
 		 381 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  27.45 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1467  Redoxin domain protein  41.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  25.36 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 		 280 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  25.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  25.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  25.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  39.58 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.2 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.71 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  27.35 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  35.56 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  31.2 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  23.84 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  31.97 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  31.3 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  25.22 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  42.62 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  28.68 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5034  Redoxin domain protein  22.73 
 
 		 394 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  29.73 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.03 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.42 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  25.6 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  28.46 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  34.43 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  39.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  24.77 
 
 		 232 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1374  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.85 
 
 		 209 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.251061  normal  0.0564426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.79 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  35.42 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  28.93 
 
 		 190 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.35 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  27.07 
 
 		 217 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  25.22 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  24.69 
 
 		 158 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.93 
 
 		 393 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4177  redoxin domain-containing protein  36.59 
 
 		 403 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  25 
 
 		 194 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>