131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1023 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  81.88 
 
 		 175 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  62.96 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  34.19 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  33.85 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  31.16 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  33.83 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  34.85 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  26.58 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  22.88 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  27.63 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  31.09 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  31.09 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  28.67 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  29.53 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  28.48 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  31.3 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  31.53 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.81 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  33.98 
 
 		 278 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  33.01 
 
 		 278 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  33.01 
 
 		 278 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  28.12 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  35.58 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  31 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  46.51 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.92 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  32.04 
 
 		 278 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 270 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  45 
 
 		 269 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 211 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  33.87 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  41.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  41.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  41.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  41.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.19 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.81 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1992  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  36.21 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.77 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  31.15 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  42.5 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  42.5 
 
 		 269 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.91 
 
 		 272 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  29.07 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  36.49 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  33.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  29.71 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  21.49 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.81 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5432  redoxin domain-containing protein  36.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97982  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  26.73 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  35.09 
 
 		 268 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  37.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  29.69 
 
 		 238 aa  43.9  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.7 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  46.15 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  40.91 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  35.56 
 
 		 278 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1374  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.05 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.251061  normal  0.0564426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  28.81 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.91 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  34.78 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36100  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  38.96 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.581528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  42 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.67 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  36.21 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  43.48 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.82 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  36.73 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  38.89 
 
 		 326 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13704  membrane-anchored thioredoxin-like protein  32.43 
 
 		 227 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  31.09 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.98 
 
 		 282 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  26.85 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  24.64 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  23.48 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  38.89 
 
 		 302 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  37.5 
 
 		 307 aa  41.6  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>